日本丹波元坚编伤寒著作，广征诸家，阐发伤寒精义，载方5首，为伤寒学重要参考。
元代倪维德眼科专著，明薛己校补，附录增补5方，为眼科要籍。
金代张元素撰，综合性医书，阐述内科杂病证治及方药，收方4首。
元代张璧（云歧子）著，脉学专著，以歌诀形式阐释脉理与辨证，指导临床。
《永类铃方》为元代李仲南编著的方书，分类收录各科方剂，共4条，为元代方剂学代表之一。
元代朱震亨学术经验集，附余增补方论，倡导滋阴降火，对后世丹溪学派发展影响深远。
元代杜清碧著，舌诊专著，以图谱形式论述伤寒舌象，为中医舌诊重要文献。
中医儿科著作《活幼心书》，元代曾世荣撰，载儿科诸病证治及方药。
元代萨谦斋《瑞竹堂经验方》之补遗，集录经验方剂。
元代王好古撰斑疹专著《斑论萃英》，论斑疹证治，收方2首。
金元名医李东垣经验效方辑录，载其临床试用有效方剂，涵盖各科。
元代医家朱震亨《丹溪心法》附录，收载丹溪学派方剂与医论，可资临床参考。
《丹溪心法心要》为元代朱震亨《丹溪心法》之节要本，以杂病证治为核心。
金元医家张璧（号云岐子）注解《脉诀》之作，阐释脉理，为脉学重要文献。
元代张璧撰脉学著作，阐述脉理与诊法，结合病证方药，指导临床。
日本片仓元周编著的产科著作附录，收录产后调治及妇科杂症方药。
金元医家李东垣所撰综合性医著，内外妇儿各科兼备，体现脾胃学说。
元代罗天益《卫生宝鉴》补遗，续添方论，涵盖内伤外感诸证，以补原书未备。
元代许国祯编纂《御药院方》，收载宋金元宫廷御用方剂千余首，剂型多样，应用广泛。
元代许国祯等编纂《御药院方》之辑选，收录宫廷方药1首，反映元代宫廷医学之一斑。
元代杜本增补舌诊专著，载有三十六舌图及证治方药。
元代朱震亨撰《格致余论》，倡“阳有余阴不足”论，为滋阴派代表作。
该书为明代《永乐大典》医药门类辑录，集录宋元以前医药文献，收载多种方剂，现存方剂一首。
元代王好古编撰的本草学专著，阐述药物气味归经理论，为药学重要典籍。
《活幼心书》为元代儿科名医曾世荣所著，其《拾遗》部分补录一方，乃儿科证治之补充。
元代杜思敬辑录的中医丛书，选录金元医家著作十九种，为金元医学重要文献汇编。
元代释继洪辑方书《澹寮集验秘方》，收录各科验方，收方1首。
明代沈之问著《解围元薮》，为麻风病专著，论述病因证治，收载专治方药。
疑为麻风专著《解围元薮》异名，论述麻风证治及方药。
眼科专著，原题孙思邈撰，实成书于宋元间，收方1首，阐述眼科证治。
