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明代李橚所撰综合性医书，以《医经小学》为蓝本扩充。广收各家学说，分述脏腑、经络、诊法、本草与各科证治，多用歌诀体裁，内容赅备，为习医者入门之津梁。
明代楼英编撰之大型类书式医著。按脏腑分部类病，折衷《内》《难》经义及各家精华，汇列诸病证治脉法。推崇《内经》、仲景，法度严谨，为明以前医学文献之钜编。
《韩氏医通》为明代韩懋所撰医论医案著作，强调四诊合参与脉理，首创“三子养亲汤”等名方，提出医德规范与行医戒律，对后世中医临证与方剂发展影响深远。
《医学正传》系明代虞传编纂综合性医著，以《内经》《难经》为宗，参合诸家，分门论述内、外、妇、儿各科证治，重在阐发其师朱丹溪学术，附以己见，切合实用。
《轩岐救正论》为明代萧京所著医论著作，针对当时滥用寒凉、时医之弊而作，倡正本清源，详论诊法、经络与药性，强调脉证合参以辨治，为明末纠偏革新之代表医籍。
《丹台玉案》为明代医家孙文胤所著综合性医书。分卷论述内、外、妇、儿各科病证，每证详考因机、脉候并附治方，其论折衷诸家，其方多有效验，是明代内容较为详备的临床参考著作。
《推求师意》为明戴思恭所撰，旨在阐发其师朱震亨（丹溪）的未尽医理。戴氏结合个人临床心得，深入推求杂病论治的微言大义，对气、血、痰、郁等病机多有发挥，是研究丹溪学派承传与创新的重要医籍。
《医旨绪余》为明孙一奎所著。该书以太极阴阳之说阐发命门、三焦等医学命题，汇通哲学与医学，力倡“生命在于气之恒动”观，并评论历代医家得失，重在探讨医理本源，拓展了命门学说的理论内涵。
《证治准绳·类方》为明代王肯堂编集的方剂汇选，是其《六科证治准绳》之重要组成部分。按病证分类，广搜博采历代名方，条理清晰，切于实用，为临床大全文献。
《证治准绳·伤寒》为明代王肯堂汇辑的伤寒证治文献，是其《六科证治准绳》中关于外感病证治的专编。辑录各家，纲目分明，为明末集大成的伤寒研究著作。
证治准绳·幼科|集明以前儿科之大成，广采历代名论，结合王肯堂个人临证心得编纂而成。全书对小儿养护、诊断及内外诸疾证治论述详备，切于实用，为后世儿科临床重要参考文献。
证治准绳·女科|王肯堂辑著，以宋·陈自明《妇人大全良方》为基础，分门别类，先论后方。该书系统整理了明以前妇产科学术经验，并融入作者见解，是研究中医妇科学的重要典籍。
